prikaz prve stranice dokumenta Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.)
No public access
master's thesis
Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.)
2021. urn:nbn:hr:181:973865
Jarić, Bernard
Josip Juraj Strossmayer University of Osijek
Department of biology

Cite this document

Jarić, B. (2021). Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.) (Master's thesis). Osijek: Josip Juraj Strossmayer University of Osijek, Department of biology. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:181:973865

Jarić, Bernard. "Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.)." Master's thesis, Josip Juraj Strossmayer University of Osijek, Department of biology, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:181:973865

Jarić, Bernard. "Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.)." Master's thesis, Josip Juraj Strossmayer University of Osijek, Department of biology, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:181:973865

Jarić, B. (2021). 'Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.)', Master's thesis, Josip Juraj Strossmayer University of Osijek, Department of biology, accessed 10 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:181:973865

Jarić B. Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.) [Master's thesis]. Osijek: Josip Juraj Strossmayer University of Osijek, Department of biology; 2021 [cited 2024 December 10] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:181:973865

B. Jarić, "Metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.)", Master's thesis, Josip Juraj Strossmayer University of Osijek, Department of biology, Osijek, 2021. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:181:973865

Please login to the repository to save this object to your list.
Metadata
TitleMetilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) DNA bijele rode (Ciconia ciconia L.)
Title (english)Methylation-sensitive amplification polymorphism (MSAP) of white stork (Ciconia ciconia L.) DNA
AuthorBernard Jarić
MentorLidija Begović (mentor)
MentorAlma Mikuška (komentor)
Committee memberRosemary Vuković (predsjednik povjerenstva)
Committee memberLidija Begović (član povjerenstva)
Committee memberAlma Mikuška (član povjerenstva)
GranterJosip Juraj Strossmayer University of Osijek
Department of biology
Osijek
Defense date and country2021-09-23, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Bijela roda (Ciconia ciconia L.) je migratorna vrsta ptice koja je raširena u Europi te nastanjuje otvorena područja, najčešće močvare i poljoprivredna zemljišta. Zbog načina ishrane ptići mogu predstavljati bioindikatore zagađenja okoliša. Epigenetske promjene uzrokuju promjene u ekspresiji gena bez da dolazi do promjene sekvence DNA, a koje se mogu prenositi i na iduće generacije. Promjene u okolišu, kao što su stres ili zagađenje, mogu uzrokovati promjenu metilacije DNA koja će dovesti do promjena u fenotipu, ponašanju, preživljavanju i prilagodbi jedinke. U ovome radu po prvi puta je određivana metilacija DNA bijele rode iz divlje populacije. DNA je izolirana iz krvi ptića s područja kontinentalne Hrvatske. Uzorci su prikupljeni tijekom prstenovanja roda 2016., 2017., i 2020. godine. Za određivanje metilacije DNA korištena je metoda metilacijsko-osjetljiva amplifikacija polimorfizama (MSAP) Nakon cijepanja DNA restrikcijskim enzimima, uslijedila je ligacija adaptera na fragmente i umnažanje sa specifičnim početnicama. Razina metilacije DNA je analizirana pomoću msap paketa u sklopu programa R. Rezultati su pokazali da postoji razlika u metilaciji DNA između ptića koji su se izlegli u različitim sezonama. Potrebna su daljnja istraživanja kako bi se utvrdio utjecaj okoliša na metilaciju DNA i ekspresiju gena specifičnih gena.
Abstract (english)
The white stork (Ciconia ciconia L.) is a migratory bird species that is widespread in Europe and inhabits open areas, most often wetlands and agricultural land. Due to their diet, birds can be are bioindicators of environmental pollution. Epigenetic variations cause changes in gene expression without a change in the DNA sequence, which can be transferred to the future generations. Changes in the environment, such as stress or pollution, can cause a change in DNA methylation that will lead to changes in the phenotype, behavior, survival, and fitness of the individual. In this work, for the first time, the methylation of white stork DNA from the wild population was determined. DNA was isolated from the blood of birds from the area of continental Croatia. Samples were collected during ringing in 2016, 2017, and 2020. Methylation-sensitive amplification of polymorphisms (MSAP) was used to determine DNA methylation. After cleavage of DNA by restriction enzymes fragments were ligated to the adapters and amplified with specific primers. The level of DNA methylation was analyzed using the msap package as part of R program. The results showed that there was a difference in DNA methylation between birds that hatched in different seasons. Further research is needed to determine the environmental impact on DNA methylation and gene expression of specific genes.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:181:973865
Study programmeTitle: Master of Science Graduate University Study Programme in Biology; specializations in: Master of Biology
Course: Master of Biology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra biologije (magistar/magistra biologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2021-09-24 09:17:43